一、tair拟南芥数据库简介
tair（The Arabidopsis Information Resource）是拟南芥信息资源库，是世界上最大的一个植物基因组数据集，在进行植物分子、遗传、生理及发育等研究时，拥有强大的数据资源。
tair拟南芥数据库包含大量的拟南芥基因信息、表型信息、突变体信息、蛋白质信息、基因调控元件信息、拟南芥学者专家信息等，是拟南芥研究领域中必不可少的数据库之一。通过tair可以对拟南芥基因进行 blast、GO、KEGG等分析，基因调控网络及货架分析等操作，为研究者分析芥菜基因组、分子表型等数据提供便利，并促进了拟南芥在植物科学、环境科学、农业科技等领域的应用。
二、tair数据库的构成及功能
1、基因信息
tair中包含所有拟南芥基因的信息，包括基因注释信息、基因分类信息、基因家族信息等。这些信息作为我们了解一个基因的基础，介绍基因的功能、表达、基因家族等信息，为研究者进行拟南芥分子生物学研究提供便利，从而推动拟南芥的研究方向和深度。
2、表型信息
tair收集了大量拟南芥的表型数据，包括形态、生理、代谢、免疫等，这些数据可以用于研究芥菜种间差异、环境适应或逆境响应等，这些数据也可以作为新品种选育的指导，加强对拟南芥的生态学、生理学、遗传学等方面的研究。
3、突变体信息
tair中收录了大量的拟南芥突变体，为研究者随时了解拟南芥的研究功能和基因调节机理提供了可靠的数据源。这些突变体都被研究过，对拟南芥的生长发育、衰老等提供了重要的信息，也为人类认识和掌握一种生物的生命规律提供了参考。
4、蛋白质信息
tair中收录拟南芥基因编码的蛋白质信息，包括蛋白质序列、蛋白质结构和功能域等。这些数据对于研究拟南芥蛋白质结构与功能、分析蛋白质质量、修饰及相互作用提供了必要的基础。
5、基因调控元件信息
tair收录了大量拟南芥基因调控元件的信息，可以深入研究基因的调控机制，进而推进拟南芥相关研究。这些数据可用于研究基因表达跨度、转录因子结构、调控因素、启动子鉴定和转录因子家族等方面。
三、tair数据库的应用
1、芥菜转录组分析
AT1G01010.1 | chr1:6789-8737 FORWARD LENGTH=1749 AT1G01020.1 | chr1:11649-13714 FORWARD LENGTH=2066 AT1G01030.1 | chr1:23191-31227 FORWARD LENGTH=972 AT1G01040.3 | chr1:31170-33153 REVERSE LENGTH=1833 AT1G01050.2 | chr1:37240-37870 FORWARD LENGTH=631 AT1G01060.1 | chr1:38430-39288 REVERSE LENGTH=859 AT1G01070.1 | chr1:43958-46062 FORWARD LENGTH=2105
芥菜转录组分析是目前研究芥菜基因表达和调控的一种主要方法，在分析芥菜转录组时，tair的作用十分重要。通过tair可以找到芥菜基因的注释信息、基因家族、调节网络等信息，解析芥菜基因表达谱，以及找出不同物种之间的差异和共同之处，发掘生物体与环境的交互作用。
2、基因组学分析
// 表示基因本身的信息 LOCUS AC005655 8342 bp DNA linear ACG 29-JUL-1999 DEFINITION Homo sapiens chromosome 14, clone RP11-275K2, complete sequence. ACCESSION AC005655 // 之后用og-repgen产生的OG文件中包含百万级别的比对信息，每个比对以BLOCK_ID分组 // BLOCK_ID=8053 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100.00 8053 1 8319 3353 501 7558 4939 802 633 7724 7124 7525 7104 7713 82 99.17 8053 2 0 0 0 26 26 0 0 33 28 29 5 20 6 100.00 8053 3 0 0 0 409 423 0 0 533 512 504 468 524 26 92.13 8053 4 0 0 0 0 0 0 0 54 53 53 49 53 2 100.00 8053 5 0 0 100 0 0 0 0 139 139 141 135 137 4 100.00 8053
tair拟南芥数据库的基因组信息一直保持最新、最全、最详细的状态，可以拓展基因组的研究领域，并为基因编辑、DNA合成、细胞工程、疾病治疗、植物育种、新品种选育等提供有力的支持。同时，通过tair可以对基因组的基本信息进行快速的检索，如查询基因本身的信息、基因组细节、基因家族等，可以快速高效地完成拟南芥基因组的研究。
3、植物基因调控网络分析
S000001 PHYB + PIF3 -> PHYB_PIF3 S000002 PHYB_PIF3 + ELONG -> PIF3 + ELONG_2 S000003 COP1 + PHYA -> PHYA_COP1 S000004 CKB1 == CKS1B
tair中的基因调控元件信息可以促进基因调控网络的分析，通过tair获取的芥菜基因组蛋白质互作信息、基因调控网络等信息，可以为生物学研究者提供数据，揭示基因的调控策略，开展植物分子生物学等研究，以进一步深入了解生物体的生命周期、环境调节等。
四、总结
tair拟南芥数据库作为拟南芥研究领域中不可或缺的数据库之一，提供了大量的基因、蛋白质、代谢、表型、突变体、基因调控元件等信息，是越来越多的科研工作者必备的数据资源。通过tair，我们可以查阅，了解、分析、预测等拟南芥基因信息，更好地认识拟南芥，推进植物分子生物学及其他领域的深入研究。