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小编给大家分享一下python读取.mtx文件的方法,希望大家阅读完这篇文章之后都有所收获,下面让我们一起去探讨吧!

Python主要用来做什么

Python主要应用于:1、Web开发;2、数据科学研究;3、网络爬虫;4、嵌入式应用开发;5、游戏开发;6、桌面应用开发。

mtx文件是按照稀疏矩阵格式存储的矩阵数据,可以按照以下步骤读取:

1、安装scanpy包

pip install scanpy

2、文件读取

import scanpy as sc 
adata = sc.readfilename)
data = adata.X

第一行read之后返回的是annData,第二行通过.X操作得到的是矩阵数据

3、转换为稠密矩阵

data = data.todense)

直接得到的矩阵是稀疏形式的,通过todense函数可转换为稠密矩阵

补充:python读取各种文件方式

Json:

use_time=[]
with openaddress,'r') as f: #ubuntu
    mobile = json.loadf)
    calls = mobile["transactions"][0]["calls"]
for call in calls: 
  use_time.appendstrcall['use_time']))

Excel:

rawdata1=open_workbookaddress)
rawdata=rawdata1.sheet_by_index0)
for i in range1,rawdata.nrows):
    if rawdata.celli,date_index).value=="": #跳过空行
        continue
    else:
        if ctype==3:  #若为3,则用datetime模块处理日期
            date1=rawdata.celli,date_index).value
            date2 = xldate_as_tupledate1,0) 
            date3=datetime*date2)
            if "." in strrawdata.celli,phone_index).value):
                phone1=strrawdata.celli,phone_index).value)[:-2]  
            else:
                phone1=strrawdata.celli,phone_index).value)

写EXCEL:

Excel_file = xlwt.Workbook) 
sheet = Excel_file.add_sheet'sheet0')
header=[u'号码','日期top1','日期top2','日期top3']
#写入标题行:
for i in rangelenheader)):
    sheet.write0,i,header[i])
#开始按行写入数据:
for i in rangelenphonelist)):
    sheet.writei+1,0,phonelist[i])
    sheet.writei+1,1,dic[strphonelist[i])])
#保存EXCEL:
Excel_file.save"C:/Users/Desktop/100个文件输出xls/"+strfileName)+".xls")

CSV:

rawdata=pd.read_csvaddress,skip_blank_lines=True) #参数为去除空行
if 'start_time' or 'begin_time'  in rawdata.columns:
    if 'start_time' in rawdata.columns:
        start_time=rawdata['start_time']
    elif 'begin_time' in rawdata.columns:
            start_time=rawdata['begin_time']

txt:

rawdata=openaddress,'r')
i=0
a=[] #c存放第一行的列名
for line in rawdata:
    if i==1: #默认第二行开始存储通话数据
        a=line.split',') #逗号作为分隔符
        for j in rangelena)): #查找指定列名所在的列下标
            if '-' in stra[j]))or'/' in stra[j]))): #判断日期所在列数
                date_index=j #保存日期的列下标
            elif  stra[j]).isdigit) and lenstra[j]))>5: #默认全为数字组成的字符串为电话号码
                phone_index=j
            else:
                pass
        break
    else:
        i+=1
i=0
for line in rawdata:#开始转存数据:
    if lenline)<10: #跳过空行
        continue
    data_line=line.split',') #txt默认以','分隔数据
    if i==0:
        pass #第一行为列名,跳过
        i+=1
    else: #从第二行开始保存数据
        start_time.appenddata_line[date_index])