一、准备工作
1、下载所需软件包
CP2K的安装需要依赖许多其他软件的支持,包括编译器、MPI等库文件,我们需要提前下载这些软件包,并解压到指定目录下,以便后续操作。
sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install libopenmpi-dev
wget https://github.com/cp2k/cp2k/releases/download/v8.1.0/cp2k-8.1.tar.bz2
tar -jxvf cp2k-8.1.tar.bz2 -C ~/
2、设置环境变量
在安装过程中,需要对环境变量做出一些设置,以便于编译和执行。我们可以在/home/username/.bashrc 文件中添加以下几行代码:
export PATH=/usr/local/cp2k/8.1/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cp2k/8.1/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LIBRARY_PATH=/usr/local/cp2k/8.1/lib:$LIBRARY_PATH
二、编译安装CP2K
1、进入解压缩后的目录,进行配置
cd ~/cp2k-8.1/
./configure CC=mpicc FC=mpif90 --with-libint --with-libxc
--with-openblas
--with-openmp
--enable-thread-multiple
--with-lapack
--with-reflapack
--without-reflapack
--with-elpa
--with-sirius
--enable-mpi
--enable-lto
--with-gnu-ld
2、编译CP2K
make -j4 -C makefiles VERSION="sopt" ARCH="Linux-x86-64-gfortran" -j4
3、安装CP2K
sudo mkdir /usr/local/cp2k/
sudo chown username /usr/local/cp2k/
make -C makefiles install VERSION="sopt" ARCH="Linux-x86-64-gfortran"
三、测试CP2K
1、下载测试文件
CP2K的安装完成后,我们需要进行一些测试,以确保其正常工作。在CP2K的官方网站上,我们可以下载到一些测试文件,进行简单的验证。首先,我们需要下载测试文件到指定目录下:
cd /usr/local/cp2k/8.1/tests/QS/
wget https://www.cp2k.org/static/downloads/tests/QS/benchmark/propylene.dmc
wget https://www.cp2k.org/static/downloads/tests/QS/benchmark/propylene.inp
2、执行测试文件
将propylene.inp拷贝到当前目录下,并使用以下命令进行执行:
cp /usr/local/cp2k/8.1/tests/QS/benchmark/propylene.inp .
mpirun -np 4 /usr/local/cp2k/8.1/exe/Linux-x86-64-gfortran/cp2k.popt propylene.inp | tee propylene.out
四、常见问题
1、编译CP2K时出现编译异常
可能是因为缺少相关库文件,我们需要使用apt-get等包管理工具安装所需的库文件,并进行重试。
2、执行测试文件时,提示找不到相关库
我们需要将CP2K所需的库文件添加到环境变量中,以便于CP2K能够正常工作。请检查上述环境变量设置是否正确。
五、总结
在以上的步骤中,我们详细介绍了CP2K的安装过程,包括准备工作、编译安装、测试以及常见问题的解决。通过这些步骤的操作,你可以成功地安装并使用CP2K,为你后续的计算化学研究提供有力的支持。