CP2K安装指南([CP2K])

一、准备工作

1、下载所需软件包

CP2K的安装需要依赖许多其他软件的支持,包括编译器、MPI等库文件,我们需要提前下载这些软件包,并解压到指定目录下,以便后续操作。

sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install libopenmpi-dev
wget https://github.com/cp2k/cp2k/releases/download/v8.1.0/cp2k-8.1.tar.bz2
tar -jxvf cp2k-8.1.tar.bz2 -C ~/

2、设置环境变量

在安装过程中,需要对环境变量做出一些设置,以便于编译和执行。我们可以在/home/username/.bashrc 文件中添加以下几行代码:

export PATH=/usr/local/cp2k/8.1/bin:$PATH 
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cp2k/8.1/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LIBRARY_PATH=/usr/local/cp2k/8.1/lib:$LIBRARY_PATH

二、编译安装CP2K

1、进入解压缩后的目录,进行配置

cd ~/cp2k-8.1/
./configure CC=mpicc FC=mpif90 --with-libint --with-libxc 
   --with-openblas 
   --with-openmp 
   --enable-thread-multiple 
   --with-lapack 
   --with-reflapack 
   --without-reflapack 
   --with-elpa 
   --with-sirius 
   --enable-mpi 
   --enable-lto 
   --with-gnu-ld

2、编译CP2K

make -j4 -C makefiles VERSION="sopt" ARCH="Linux-x86-64-gfortran" -j4

3、安装CP2K

sudo mkdir /usr/local/cp2k/
sudo chown username /usr/local/cp2k/
make -C makefiles install VERSION="sopt" ARCH="Linux-x86-64-gfortran"

三、测试CP2K

1、下载测试文件

CP2K的安装完成后,我们需要进行一些测试,以确保其正常工作。在CP2K的官方网站上,我们可以下载到一些测试文件,进行简单的验证。首先,我们需要下载测试文件到指定目录下:

cd /usr/local/cp2k/8.1/tests/QS/
wget https://www.cp2k.org/static/downloads/tests/QS/benchmark/propylene.dmc
wget https://www.cp2k.org/static/downloads/tests/QS/benchmark/propylene.inp

2、执行测试文件

将propylene.inp拷贝到当前目录下,并使用以下命令进行执行:

cp /usr/local/cp2k/8.1/tests/QS/benchmark/propylene.inp .
mpirun -np 4 /usr/local/cp2k/8.1/exe/Linux-x86-64-gfortran/cp2k.popt propylene.inp | tee propylene.out

四、常见问题

1、编译CP2K时出现编译异常

可能是因为缺少相关库文件,我们需要使用apt-get等包管理工具安装所需的库文件,并进行重试。

2、执行测试文件时,提示找不到相关库

我们需要将CP2K所需的库文件添加到环境变量中,以便于CP2K能够正常工作。请检查上述环境变量设置是否正确。

五、总结

在以上的步骤中,我们详细介绍了CP2K的安装过程,包括准备工作、编译安装、测试以及常见问题的解决。通过这些步骤的操作,你可以成功地安装并使用CP2K,为你后续的计算化学研究提供有力的支持。

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风君子

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